1、由于要完成业务闭环管理，质量管理，及数据的标准，统一性，在操作复杂度上比现有的系统相对复杂些，通俗讲，就是需要关注和操作的环节多。（比如用血安全管理，需要各个环节采集信息，配血，申请，审核，出库，运送，输血，等）
2、由于引入的知识库较多，操作者和系统的互动信息多，需要时刻关注信息系统所给的提示，这也是主要为医疗质量管理服务。（医保用药提醒，抗生素使用提示，大处方管理等）医生，护士的操作受限制较多。
3、信息量增大，文本，数字，图像，视频，各种文件格式，各种票据，各种码管理，各种便民流程，需要医生、护士为患者服务的内容增多。（比如诊间支付，自助机服务，支付宝，网银服务等）
4、新系统采用的是浏览器界面，不同于传统的程序界面，鼠标的使用增多，选择的内容增多，自主输入的内容减少，需要一定的适应期。